En el Departamento de Microbiología del Instituto de Investigaciones Médicas Alfredo Lanari – UBA, se realizan actividades asistenciales, docentes y de investigación clínica.El servicio funciona en dos turnos, de lunes a viernes desde las 7,00 hs. hasta las 17 hs. y los sábados de 8 a 13 hs.

Con respecto a la actividad asistencial se realiza el diagnóstico etiológico de los procesos infecciosos de los pacientes que acuden a la institución; es decir, de los internados en las salas de Clínica Médica, Cuidados Intensivos, de los pacientes quirúrgicos, de los pacientes con insuficiencia renal aguda y crónica terminal en hemodiálisis o en diálisis peritoneal, de los pacientes en plan de trasplante renal y los trasplantados y de los pacientes ambulatorios que se atienden en los consultorios externos.

También se realizan estudios de pacientes pertenecientes a distintas obras sociales y sistemas de medicina prepaga.

Con respecto a la actividad docente se imparte a los residentes (bioquímicos y médicos), concurrentes y pasantes. Se dictan cursos/clases de la especialidad dentro y fuera del Instituto.

Con respecto a la investigación clínica, en el servicio se siguen las siguientes líneas de trabajo:

1. Taxonomía e infecciones asociadas a los estafilococos coagulasa negativos y coagulasa positivos.
2. Infección e infertilidad masculina
3. Infecciones en los pacientes con insuficiencia renal crónica terminal en hemodiálisis y diálisis peritoneal
4. Bacterias anaerobias: infecciones asociadas, taxonomía y mecanismos involucrados en las variaciones de los perfiles de sensibilidad

• Jefe Departamento: Dra. Adriana Noemí De Paulis.
  • Bioquímica – UBA.
  • Especialista en Microbiología Clínica (Asociación Argentina de Microbiología).
  • Especialista en Bacteriología Clínica (Ministerio de Salud de la Nación)
  • Vice-Presidente de la Asociación de Profesionales del Instituto de Investigaciones Médicas A. Lanari (APIIM) – UBA.

• Jefe División Bacteriología: Dra. Eugenia Bertona.
  • Bioquímica – Universidad Nacional de Córdoba.
  • Especialista en Bioquímica Clínica, Área Bacteriología Clínica (UBA)
  • Especialista en Bacteriología Clínica (Ministerio de Salud de la Nación)

• Dra. Natalia Mangieri: Bacterias Anaerobias y Microorganismos relacionados
  • Bioquímica – UBA.
  • Especialista en Microbiología Clínica Universidad Católica Argentina.
  • Miembro de la Subcomisión de Bacterias Anaerobias de la Sociedad Argentina de
    Bacteriología Clínica (SADEBAC) – Asociación Argentina de Microbiología.

• Dra. Daiana Guevara Núñez: Bacterias Aerobias y Facultativas
  • Bioquímica (UNIVERSIDAD NACIONAL DEL SUR).
  • Especialidad en Microbiología Clínica Universidad Católica Argentina. En curso.
  • Lic. Viviana Stuchi
  • Técnica de Laboratorio en Análisis Clínicos.
  • Licenciada en Ciencias Biológicas – Fac. de Ciencias Exactas y Naturales – UBA.

• Graciela Vázquez
  • Técnica de Laboratorio en Análisis Clínicos.
  • Técnica en Hemoterapia e Inmunohematología.

• Yesica Daiana Onano
  • Técnica en procedimientos de Microbiologia con orientación en Bacteriologia
  • Tecnica en Laboratorio de Análisis Clínicos. En curso

• Residentes que realizan la rotación programada por Microbiología: dos por año por un período de seis meses cada uno y el año electivo (4º año de la residencia) cuando el servicio es elegido por el residente.

• Pasantes que realizan su tesis de grado en Microbiología

• Información útil para los pacientes ambulatorios

  Plazo habitual de entrega de los resultados: el intervalo en el plazo de entrega de los resultados oscila entre 24 hs. y 2 meses, dependiendo de la naturaleza del material en estudio y el tipo de examen a realizar.

  Ej.: 1. Urocultivo sin reacción inflamatoria, cuya coloración de Gram es negativa y el cultivo también es negativo se informa a las 24 hs.

  • Todos aquellos materiales que requieren Cultivo para Koch se mantienen en estudio hasta 2 meses.
  • Todos aquellos materiales que requieren examen micológico se mantienen en estudio hasta 2 meses.
  • Los hemocultivos y los líquidos de punción se mantienen en estudio hasta 14 días.
  • El resto de los materiales se informa entre los 2 y 7 días.

  Valores de referencia de las prácticas:

  Todos aquellos materiales NOBLES, es decir que son naturalmente estériles, si el proceso infeccioso está ausente son negativos.

  Todos aquellos materiales que provienen de mucosas con flora normal, si el proceso infeccioso está ausente, simplemente se aísla esa flora normal.

  Material sobre el cual se realiza la determinación:

  Definido por la naturaleza del mismo. Ej: urocultivo sobre orina; coprocultivo sobre materia fecal, hemocultivo sobre sangre entera; esputo sobre expectoración significativa; etc.

El examen microbiológico de los materiales que se detallan a continuación incluye: el estudio bacteriológico, micobacteriológico y micológico.

• Se realizan exámenes en fresco, coloraciones, improntas para inmunofluorescencia directa (IFD), junto con los cultivos en los medios adecuados para la búsqueda de las múltiples bacterias aerobias, anaerobias facultativas, anaerobias estrictas, micobacterias, hongos y levaduras, micoplasmas y clamidias.
• Se realiza la identificación bioquímica con la búsqueda de los antígenos de los agentes etiológicos aislados y de las toxinas, cuando corresponde, y las pruebas de sensibilidad a los distintos antibióticos por los métodos cualitativos y/o cuantitativos. También se realiza el monitoreo de la terapia antimicrobiana, cuando corresponde.

Materiales del tracto respiratorio superior

• Exudado de fauces
• Material nasofaríngeo
• Hisopado nasal
• Punción de senos paranasales
• Secreciones de oído externo y medio

Materiales del tracto respiratorio inferior

• Esputo (obtenido por expectoración espontánea o inducido)
• Lavado gástrico (para Mycobacterium tuberculosis)
• Aspirado endotraqueal
• Lavado bronquial
• Lavado broncoalveolar (BAL)
• Cepillado pulmonar (a través del cepillo envainado)
• Biopsia transbronquial
• Biopsia pulmonar (a cielo abierto)
• Punción aspiración pulmonar
• Líquido pleural
• Biopsia pleural

Materiales del tracto genitourinario

• Urocultivo (orina obtenida por: micción espontánea, punción de sonda vesical, punción suprapúbica)
  Exudado uretral
  Flujo vaginal
  Exudado endocervical
  Material intrauterino
  Cálculos (renales, prostáticos, etc.)

Materiales del tracto genitourinario

• Urocultivo (orina obtenida por: micción espontánea, punción de sonda vesical, punción suprapúbica)
• Exudado uretral
• Flujo vaginal
• Exudado endocervical
• Material intrauterino
• Cálculos (renales, prostáticos, etc.)

Otros materiales

• Hemocultivo seriado automatizado
• Retrocultivo
• Punta de catéter
• Médulocultivo
• Líquido cefalorraquídeo
• Otros líquidos de punción: articular, pericárdico, etc.
• Biopsias
• Abscesos
• Heridas superficiales y profundas
• Secreción conjuntival

Estudios Especiales

Estudio microbiológico de la vía seminal:

PROSTATITIS CRÓNICA: incluye los siguientes materiales:

• Hisopado uretral
• Orina, primera porción de la micción (5 – 10ml)
• Orina, chorro medio
• Líquido prostático
• Orina post masaje prostático (3 – 5 ml)

Infertilidad masculina y/o infección en glándulasANEXAS : incluye los siguientes materiales:

• Hisopado uretral
• Orina, primera porción de la micción (5 – 10 ml)
• Orina, chorro medio
• Líquido prostático
• Orina pos masaje prostático (3 – 5 ml)
• Semen

• Estudios de vigilancia: incluyen la investigación microbiológica de los microorganismos de patogenicidad reconocida y/o potencialmente patógenos en las diferentes mucosas (ej. hisopados: de fauces, nasal, rectal, axilar, de pericatéter, cuando corresponda)
• Estudios de portación: orientados hacia la búsqueda de:
  • Neisseria meningitidis, Haemophilus influenzae, Streptococcus pyogenes, Streptococcus agalactiae (en las embarazadas), Listeria monocytogenes, (en las pacientes con abortos a repetición), Staphylococcus aureus resistente a la meticilina, enterococos resistentes a la vancomicina, enterobacterias portadoras de beta-lactamasas de espectro extendido (BLEE), microorganismos portadores de carbapenemasas (metalo-beta-carbapenemasas y serin-carbapenemasas) y de cualquier otra disbacteriosis/ micosis (en los pacientes neutropénicos).

• Estudio de las peritonitis infecciosas en los pacientes en diálisis peritoneal [continua ambulatoria (DPCA) y automatizada (DPA)]:
  • Líquidos de DPCA y DPA
  • Secreción pericatéter
• Control microbiológico de los sistemas de aguas de hemodiálisis:
  • gua de red
  • agua pre-ósmosis reversa
  • agua pos-ósmosis reversa
  • agua de los últimos puestos de diálisis de todas las salas
  • agua de las salas de lavado de los filtros
• Monitoreo de la terapia antibiótica: incluye las determinaciones de :
  • Concentraciones inhibitoria y bactericida mínimas (CIM – CBM)
  • Poderes inhibitorio y bactericida del suero (PIS – PBS)
  • Combinación de antibióticos (para la determinación de sinergia, sinergia bactericida, aditividad, indiferencia y antagonismo). Método: cinético o de las curvas de letalidad en función del tiempo.

Determinaciones Especiales

• Examen micológico: para micosis superficiales, oportunistas y profundas.
• Cultivo para Koch: incluye baciloscopía o coloración de Ziehl Neelsen y cultivo en los medios de Lowestein Jensen, Stonebrink y en los frascos Myco F Lytic  del sistema automatizado de hemocultivos BACTEC 1290 (BD-Argentina).
• Investigación de bacterias anaerobias:
  • cultivo
  • identificación bioquímica hasta el nivel de especie, subespecie o biovariedad
  • pruebas de sensibilidad (métodos: de elución y de dilución en medio sólido)
• Investigación de micoplasmatales (Ureaplasma urealyticum, Mycoplasma hominis, etc.):
  • cultivo
  • identificación bioquímica
• Investigación de Chlamydia trachomatis: por IFD.
• Investigación de Pneumocystis jirovecii: por coloración de Azul de Orto – Toluidina modificada y Giemsa.
• Investigación de Cryptosporidium spp. e Isospora belli: por coloración de Ziehl Neelsen modificada.
• Identificación de antígenos bacterianos y micóticos en diferentes materiales biológicos (ej.: de Streptococcus pneumoniae en orina, de Cryptococcus neoformans en LCR, etc.)
• Investigación de toxinas (A+B) de Clostridium difficile por inmunocromatografía y cultivo de Clostridium difficile.
• Investigación de Helicobacter pylori: en las biopsias (cuerpo y antro) obtenidas vía endoscópica de los pacientes con gastritis y/o úlceras gástricas. Se realiza cultivo, identificación bioquímica y pruebas de sensibilidad cuantitativas.

Otras determinaciones

• Coloraciones: Gram, Ziehl Neelsen, Giemsa, Kinyoun, etc.
• Exámenes en fresco y Tinta China.
• Antibiograma cualitativo: método de difusión en placa con monodiscos (a elección según el agente etiológico aislado y el sitio de la infección).
• Detección de beta – lactamasas: método de Nitrocefín (cefalosporina cromogénica).
• Conteos de colonias: en orinas, catéteres, retrocultivos, hemocultivos, etc.

Controles de Calidad Externos

El Departamento de Microbiología participa en los Programas Nacionales de Control de Calidad en BACTERIOLOGÍA y en MICOLOGÍA del Ministerio de Salud, Secretaría de Políticas de Regulación Sanitaria, INEI-ANLIS “Dr. Carlos G. Malbrán”.

En la mañana al levantarse realizar:

• Cepillado de dientes
• Enjuagues bucales con:
• Solución de bicarbonato de sodio (1 cucharadita en medio vaso de agua), o
• Solución de agua oxigenada (1 cucharada de 10 volúmenes en medio vaso de agua)
• Recolectar laprimera expectoración de la mañanaen frasco estéril de boca ancha, para ello:
  • Toser con fuerza 2 ó 3 veces y expectorar directamente dentro del frasco, evitando se agregue saliva; colocarsólo una expectoración en el frasco
  • Si la expectoración fuera escasa, INDUCIR el esputo mediante:
    • Fisioterapia torácica
    • Drenaje postural
    • Nebulizaciones con solución fisiológica (3 a 4 por día, 1 ó2 días previos a la recolección de la muestra)
• Traer el esputo al Instituto, sector Extracciones (subsuelo del 1er. Cuerpo), antes de las 10 hs. junto con la “Solicitud de pedido” completada por el médico y autorizada por la Obra Social.

Si Ud. no puede traer o enviar la muestra el mismo día de realizada la extracción, puede conservarla en heladera (a 4 – 8 ºC,NO congelar), hasta 24 hs. Lo ideal es que su muestra sea procesada el mismo día de la recolección.

• Se debe realizar un seriado de 3 días consecutivos, respetando las indicaciones descriptas en la recolección para cada uno de los esputos.
• Remitir las muestras al Instituto cada día. Si Ud. vive muy lejos, luego de extraído cada esputo colocarlo en heladera (no congelar), y traer los 3 frascos en la mañana del tercer día.
SI UD. CUMPLE ESTRICTAMENTE CON ESTAS INDICACIONES EL UNICO BENEFICIADO SERA UD.

• Recolectar la primera orina de la mañana o con más de 3 hs. de retención.
• Para ambos sexos, pacientes adultos: realizar higiene cuidadosa de genitales externos con agua y un jabón nuevo.

SEXO MASCULINO: realizar la higiene con el prepucio retraído.

• Enjuague con abundante agua.
• Secado con gasa estéril o con una toalla perfectamente limpia.

SEXO FEMENINO:

• la mujer adulta debe separar labios y hacer TAPONAMIENTO VAGINAL con una torunda de algodón envuelta en gasa, o con un tampón vaginal comercial (tipo los OB).
• Emitir la orina en un frasco estéril de boca ancha, descartar la primera porción de la micción y recolectar el chorro medio (unos 30 a 40 ml).
• Traer la orina al Instituto, sector Extracciones (subsuelo del 1er. Cuerpo), antes de las 10 hs. junto con la “Solicitud de pedido” completada por el médico y autorizada por la Obra Social.

Si Ud. no puede traer o enviar la muestra el mismo día de realizada la extracción y dentro de las 3 hs. de recolectada, puede conservarla en heladera (a 4 – 8 ºC, NO congelar), hasta 24 hs. Lo ideal es que su muestra sea procesada el mismo día de la recolección. Si tarda más de 3 hs. en llegar al Instituto, tráigala refrigerada. (Ponga el frasco perfectamente cerrado y derecho que no se vuelque, en una caja de telgopor o plástica con hielo o con un refrigerante).

• Se debe realizar un seriado de 3 días consecutivos, respetando las indicaciones descriptas en la recolección para cada una de las orinas.
• Remitir las muestras al Instituto cada día. Si Ud. vive muy lejos, luego de extraída cada orina colocarla en heladera (no congelar), y traer los 3 frascos en la mañana del tercer día.

SI UD. CUMPLE ESTRICTAMENTE CON ESTAS INDICACIONES EL UNICO BENEFICIADO SERA UD.

Este estudio se realiza en los pacientes con DIARREA (que tengan por lo menos 3 deposiciones diarias de heces diarreicas, en los últimos 2 días).

La materia fecal formada, NO debe ser recolectada.

• Evacuar en una chata o similar (previamente, perfectamente higienizada con agua y jabón), teniendo la precaución de no orinar simultáneamente.
• Colocar aproximadamente una cucharada de las porciones más mucopurulentas, mucosas o sanguinolentas en el frasco estéril con un medio de transporte que provee el Departamento de Microbiología del Instituto. Utilizar una cuchara de plástico descartable.
• Traer la muestra al Instituto, sector Extracciones (subsuelo del 1er. Cuerpo), antes de las 10 hs. junto con la “Solicitud de pedido” completada por el médico y autorizada por la Obra Social.

Si Ud. no puede traer o enviar la muestra el mismo día de realizada la extracción, puede conservarla en heladera (a 4 – 8 ºC, NO congelar), hasta 24 hs.

Lo ideal es que su muestra sea procesada el mismo día de la recolección.

BÚSQUEDA DE TOXINAS DE Clostridium difficile (A + B) en pacientes con diarrea asociada a antibióticos o quimioterápicos

Este estudio se realiza en los pacientes con DIARREA (que tengan por lo menos 3 deposiciones diarias de heces diarreicas, en los últimos 2 días) y que hayan recibido antibióticos o quimioterápicos en los 2 meses previos a la aparición de la diarrea. La materia fecal formada, NO debe ser recolectada.

• Evacuar en una chata o similar (previamente, perfectamente higienizada con agua y jabón), teniendo la precaución de no orinar simultáneamente.
• Colocar aproximadamente una cucharada de las porciones más mucopurulentas, mucosas o sanguinolentas (10-20 ml, mínimo 5 ml ó 5 gramos) en un frasco SIN conservantes (ej. frasco para urocultivo con tapa a rosca). Utilizar una cuchara de plástico descartable.
• Traer la muestra al Instituto, sector Extracciones (subsuelo del 1er. Cuerpo), antes de las 10 hs. junto con la “Solicitud de pedido” completada por el médico y autorizada por la Obra Social.

Si Ud. no puede traer o enviar la muestra el mismo día de realizada la extracción, puede conservarla en heladera (a 4 – 8 ºC, NO congelar), hasta 48 hs.

Lo ideal es que su muestra sea procesada el mismo día de la recolección.

En cada caso y sin excepción, cada muestra se acompañará de la SOLICITUD DE PEDIDO (del Departamento de Microbiología del Instituto), donde se deberán consignar los siguientes datos:

• Paciente: apellido y nombre
• Edad
• Nº de Historia Clínica (si la tiene)
• Enfermedad de base
• Tratamiento antibiótico: cuál y por cuánto tiempo
• Idem para los quimioterápicos
• Si estuvo internado: cantidad de días
• Fecha de recolección de la muestra
• Firma del médico solicitante